Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPAARA0A1B0GVQ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAARA0A1B0GVQ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPAARA0A1B0GVQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAARA0A1B0GVQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAARA0A1B0GVQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAARA0A1B0GVQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAARA0A1B0GVQ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPAARA0A1B0GVQ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPAARA0A1B0GVQ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPAARA0A1B0GVQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPAARA0A1B0GVQ0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAARA0A1B0GVQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAARA0A1B0GVQ0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPAARA0A1B0GVQ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPAARA0A1B0GVQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAARA0A1B0GVQ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAARA0A1B0GVQ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAARA0A1B0GVQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAARA0A1B0GVQ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPAARA0A1B0GVQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPAARA0A1B0GVQ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPAARA0A1B0GVQ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SPAARA0A1B0GVQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPAARA0A1B0GVQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPAARA0A1B0GVQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPAARA0A1B0GVQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPAARA0A1B0GVQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms