Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FMOD-201ENST00000354955 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 USP32P1-203ENST00000417524 1014 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC011498.1-203ENST00000589066 359 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 GBA3-203ENST00000508166 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL355483.4-201ENST00000432653 470 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 DGKG-202ENST00000344484 3445 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC012360.3-201ENST00000610036 3449 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 NUMB-211ENST00000554521 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms