Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
V9GYY9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
V9GYY9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
V9GYY9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
V9GYY9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
V9GYY9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
V9GYY9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
V9GYY9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
V9GYY9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
V9GYY9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
V9GYY9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
V9GYY9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
V9GYY9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
V9GYY9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms