Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
V9GYH0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V9GYH0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V9GYH0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
V9GYH0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
V9GYH0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
V9GYH0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
V9GYH0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms