Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PAXBP1Q9Y5B6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms