Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9Y3F1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9Y3F1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms