Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHOC2Q9UQ13 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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