Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNRGQ9UMZ2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNRGQ9UMZ2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms