Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRID1Q9ULK0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms