Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIX4Q9UIU6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX4Q9UIU6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms