Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGXB4Q9UGU5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGXB4Q9UGU5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms