Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM10Q9UDY6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM10Q9UDY6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms