Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms