Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EXTL2Q9UBQ6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms