Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CC2D2AQ9P2K1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CC2D2AQ9P2K1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms