Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP36Q9P275 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms