Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNTN3Q9P232 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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