Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSRB1Q9NZV6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSRB1Q9NZV6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms