Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms