Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MS4A12Q9NXJ0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A12Q9NXJ0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms