Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR3EQ9NVU0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms