Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MEPEQ9NQ76 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms