Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FZD3Q9NPG1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms