Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms