Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
XPO4Q9C0E2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPO4Q9C0E2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPO4Q9C0E2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPO4Q9C0E2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPO4Q9C0E2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms