Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA4CQ9C0C4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms