Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF4Q9BZC1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms