Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC8Q9BY41 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms