Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDCA4Q9BXL8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDCA4Q9BXL8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms