Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP4Q9BWG4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSBP4Q9BWG4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms