Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC94Q9BW85 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms