Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms