Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP19Q99542 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms