Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAMKK2Q96RR4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMKK2Q96RR4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms