Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP3Q96P20 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms