Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms