Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNBD2Q96M20 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms