Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM44Q96DX7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM44Q96DX7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms