Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C2Q8WUA4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C2Q8WUA4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms