Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPC24Q8NBT2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPC24Q8NBT2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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