Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC63Q8NA47 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC63Q8NA47 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms