Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMER3Q8N944 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms