Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00518Q8N0U6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms