Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC9A9Q8IVB4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A9Q8IVB4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms