Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNMB4Q86W47 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms