Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMC6Q7Z403 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMC6Q7Z403 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMC6Q7Z403 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMC6Q7Z403 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMC6Q7Z403 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMC6Q7Z403 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMC6Q7Z403 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMC6Q7Z403 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMC6Q7Z403 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms