Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00299Q6ZSB3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms