Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC41PQ6P2S7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC41PQ6P2S7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms