Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CARMIL2Q6F5E8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CARMIL2Q6F5E8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms