Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATL3Q6DD88 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms